Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซเทลไลต์สำหรับเอคโตไมคอร์ไรซาเห็ดเผาะ Astraeus hygrometricus (Pers.) Morgan

Other Title (Parallel Title in Other Language of ETD)

Developmentof microsatellite markers for ectomycorrhizal fungus Astraeus hygrometricus (Pers.) Morgan

Year (A.D.)

2006

Document Type

Thesis

First Advisor

จิตรตรา เพียภูเขียว

Second Advisor

วรวุฒิ จุฬาลักษณานุกูล

Faculty/College

Faculty of Science (คณะวิทยาศาสตร์)

Degree Name

วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Degree Level

ปริญญาโท

Degree Discipline

พฤกษศาสตร์

DOI

10.58837/CHULA.THE.2006.1012

Abstract

เห็ดเผาะหรือเห็ดถอบ Astraeus hygrometricus (Pers.) Morgan เป็นเห็ดที่มีความสำคัญ ทางการค้าและนิยมบริโภคเป็นอาหารในประเทศไทย เห็ดเผาะเป็นราเอคโตไมคอร์ไรซาซึ่งอาศัยอยู่ร่วมกันกับพืชที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจในป่าไม้ยางนา ในปัจจุบันความรู้เกี่ยวกับโครงสร้างทางพันธุศาสตร์ประชากรทั้งบนดินและใต้ดินและระบบการสืบพันธุ์ของเห็ดชนิดนี้ยังไม่มีรายงาน ซึ่งการวิจัยในด้านพันธุ-ศาสตร์ประชากรนั้นต้องการเครื่องหมายพันธุกรรมที่แสดงถึงระดับของความแปรผันที่เหมาะสมสำหรับใช้ในการศึกษา ด้วยเหตุนี้จึงได้พัฒนาเครื่องหมายไมโครแซเทลไลต์โดยเทคนิค inter-simple sequence repeat (ISSR)-suppression-PCR จำนวนทั้งหมด 11 ตำแหน่ง โดยได้เครื่องหมายไมโครแซเทลไลต์จำนวน 4 ตำแหน่งที่มีโพลีมอร์ฟิซึม ได้แก่ CA -05 GTC-01 GTC-04 และ GTC-05 ซึ่งมีจำนวนอัลลีล 2 - 7 อัลลีลต่อตำแหน่ง มีค่าเฮเทโรไซโกซิตีที่คาดหมายและค่าเฮเทโรไซโกซิตีที่คำนวณได้อยู่ในช่วง 0.275 ถึง 0.450 และ 0.025 ถึง 0.175 ตามลำดับ เครื่องหมายไมโครแซเทลไลต์ 2 ตำแหน่ง คือ CA -05 และ GTC-05 ไม่สามารถเพิ่มจำนวนชิ้นส่วนดีเอ็นเอจากเอคโตไมคอร์ไรซาชนิดอื่น ๆ ที่ทำการศึกษาได้ ชี้ให้เห็นว่าเครื่องหมายไมโครแซเทลไลต์นี้เป็นเครื่องหมายที่จำเพาะกับเห็ดเผาะ สามารถนำไปใช้ในการศึกษา เอคโตไมคอร์ไรซาและกลุ่มของเส้นใยในดิน เครื่องหมายไมโครแซเทลไลต์ที่มีโพลีมอร์ฟิซึมซึ่งได้จากการวิจัยนี้สามารถนำไปใช้ในการศึกษาโครงสร้างทางพันธุศาตร์ประชากรและการสืบพันธุ์ในเห็ดเผาะสำหรับการศึกษาในอนาคตได้ อีกทั้งยังสามารถใช้เป็นเครื่องมือในการติดตามการอยู่รอดของสายพันธุ์เห็ดเผาะ ที่ใส่ให้กับกล้าไม้เพื่อใช้ในการปลูกป่าหลังจากการย้ายต้นกล้าไม้สู่พื้นที่ปลูกจริง

Other Abstract (Other language abstract of ETD)

Astraeus hygrometricus (Pers.) Morgan is commercially important and edible mushroom in Thailand. This species forms ectomycorrhizal associated with a wide range of economically important host trees in Dipterocarp forests. Until now, knowledge about above and below ground population genetic structure and reproduction in this species has not been reported yet. Population genetic research requires genetic markers that exhibit levels of variability appropriated for use in studies. Therefore, eleven co-dominant microsatellite markers were developed using an inter-simple sequence repeat (ISSR)-suppression- PCR technique. Four polymorphic loci, CA -05, GTC-01, GTC-04 and GTC-05, were characterized varying from two to seven alleles per locus. The observed and expected heterozygosites ranged from 0.025 to 0.175 and 0.275 to 0.450, respectively. The two microsatellite loci, CA-05 and GTC-05, did not amplify any other ectomycorrhizal species, indicating that they were species-specific markers. These microsatellite markers could be employed to investigate this ectomycorrhizae and mycelial aggregation in the soil. The polymorphic microsatellite markers obtained from this research could be used to investigate the population genetic structure and reproduction in this species for further studies. Furthermore, these markers could be used to monitor the environmental survival of this ectomycorrhizae after inoculated seedlings are transplanted into the site of plantations.

Link to Full Text

Share

COinS