การวิเคราะห์รูปแบบทางพันธุกรรมของหมู่เลือด MNS hybrid glycophorin (B-A-B) ในผู้บริจาคโลหิตคนไทย โดยใช้เทคนิค High Resolution Melting Assay

Other Title (Parallel Title in Other Language of ETD)

Genotyping analysis of new MNS hybrid glycophorins GYP*(B-A-B) in the Thai blood donors using high resolution melting assay

Author

พลอยมณี สุวรรณวุฒิชัย, คณะสหเวชศาสตร์

Year (A.D.)

2020

Document Type

Thesis

First Advisor

ภัทริน ตั้งธนตระกูล

Second Advisor

ทัศนีย์ สกุลดำรงค์พานิช

Faculty/College

Faculty of Allied Health Sciences (คณะสหเวชศาสตร์)

Department (if any)

Department of Transfusion Medicine and Clinical Microbiology (ภาควิชาเวชศาสตร์การธนาคารเลือดและจุลชีววิทยาคลินิก)

Degree Name

วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Degree Level

ปริญญาโท

Degree Discipline

วิทยาศาสตร์ระดับโมเลกุลทางจุลชีววิทยาทางการแพทย์และวิทยาภูมิคุ้มกัน

DOI

10.58837/CHULA.THE.2020.1043

Abstract

ในปี 2018 มีการค้นพบ hybrid GP(B-A-B) ชนิดใหม่ซึ่งเกิดจากจีโนไทป์ แบบ homozygous GYP*Mur สร้างเป็นแอนติเจนใหม่เรียก JENU ลบ ในประชากรชาวไทย ดังนั้นเพื่อศึกษาความถี่ของจีโนไทป์แบบ hydrid GYP*Mur และ hybrid GYP ชนิดอื่นๆ ผู้วิจัยอาศัยเทคนิค Polymerase chain reaction High-Resolution Melting (PCR HRM) ตัวอย่างดีเอ็นเอที่สกัดได้จากผู้บริจาคโลหิตชาวไทย จำนวน 60 ราย ที่ให้ผลตรวจแอนติเจน s เป็นลบปลอมกับน้ำยา monoclonal IgM clone P3BER ผลค่า melting temperature จากตัวอย่างพีซีอาร์ที่ได้จะนำมาเปรียบเทียบกับตัวอย่าง homozygous GYP*Mur การหาลำดับเบสใช้ในตัวอย่างที่เป็น non-homozygous GYP*Mur ทุกตัวอย่าง จากผลการทดลอง พบว่า ผู้บริจาคโลหิตจำนวน 49 รายเป็น homozygous GYP*Mur (Tm เฉลี่ย 79.63±0.03, 90% Cl =79.337-81.302 ) และ อีก 11 รายเป็น non-homozygous GYP*Mur เมื่อเปรียบเทียบลำดับเบสของตัวอย่างดังกล่าวกับฐานข้อมูล พบว่า ตัวอย่างพบว่า 4 รายเป็น heterozygous GYP*Mur/Bun, 2 ราย เป็น homozygous GYP*Bun และ 5 ราย เป็น heterozygous GYP*BS/GYP*Bun สรุปผลการศึกษาครั้งนี้ คือ ความถี่ของแอนติเจน JENU ลบ คิดเป็นร้อยละ 0.65 ของประชากรชาวไทย โดยเทคนิค PCR HRM สามารถนำไปใช้ในงานประจำวันทางธนาคารเลือดได้จริง

Other Abstract (Other language abstract of ETD)

Recently, a novel hybrid MNS GP(B-A-B) called JENU – antigen (homozygous GYP*Mur) was discovered in Thai population. By using polymerase chain reaction (PCR) high-resolution melting (HRM), our study aims to investigate the prevalence of homozygous GYP*Mur and other hybrid GYP*(B-A-B) in Thai blood donors. The DNA were extracted from 60 blood donor samples which gave false negative with monoclonal anti-s IgM clone P3BER. Melting temperature (Tm) of PCR products were compared with known (homozygous GYP*Mur) using 90% confident interval (CI). Sanger sequencing is used to confirm all samples of non-homozygous GYP*Mur. Result found that 49 of 60 samples were homozygous GYP*Mur while 11 samples were non-homozygous GYP*Mur. Interestingly, 4 of 11 samples were heterozygous GYP*Mur/Bu, whereas 2 samples are homozygous GYP*Bun. Five samples are heterozygous GYP*BS/GYP*Bun. In conclusion, prevalent of homozygous GYP*Mur (JENU-) in Thai blood donors was 0.65%. The PCR HRM assay could be used to identify GYP*Mur homozygous and screen for other hybrid GYP*(B-A-B) variants.

Creative Commons License

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-No Derivative Works 4.0 International License.

Recommended Citation

สุวรรณวุฒิชัย, พลอยมณี, "การวิเคราะห์รูปแบบทางพันธุกรรมของหมู่เลือด MNS hybrid glycophorin (B-A-B) ในผู้บริจาคโลหิตคนไทย โดยใช้เทคนิค High Resolution Melting Assay" (2020). Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD). 3701.
https://digital.car.chula.ac.th/chulaetd/3701